Saint Jean-Baptiste de la Salle fonde la congrégation des Frères des Ecoles Chrétiennes au XVIIe siècle, il y a 350 ans. Il propose une école gratuite pour éduquer les enfants des familles pauvres. Aujourd’hui les Frères sont présents dans 80 pays du monde.

En 2000, les Frères des Ecoles Chrétiennes et les laïcs non religieux s’associent pour remplir ensemble le service d’éducation.
En France, 145 établissements vivent sous l’inspiration de la tutelle lasallienne.

L'Institution d’Agen remonte à 1839. Félix Aunac est un banquier agenais qui a sauvé notre établissement de la fermeture en 1905, lorsqu’a été promulguée la loi de séparation de l’Eglise et de l’Etat.

D’abord école de garçons, l’institution devient mixte en 1968. En 1974, s’ouvre la section d’enseignement spécialisé. En 2003, l’institution salue avec tristesse le départ de Frères Bernard, Henri et Jean-Marie. En 2004, Mme Marie-Josée Mauriège, Directrice de l’école depuis 21 ans, est remplacée par Melle Céline Tauzin et en 2007 M. Régis Laurent-Vauclare, Chef d’établissement coordinateur, par Mme Colette ALLIX .

En 2007, 1160 élèves sont scolarisés à Félix Aunac.